Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CHAF1BQ13112 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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