Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HSPB3Q12988 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HSPB3Q12988 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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