Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BNIP3Q12983 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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