Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CNTN1Q12860 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
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