Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CGNL1Q0VF96 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGNL1Q0VF96 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms