Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PSME1Q06323 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms