Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OC90Q02509 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms