Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC6A3Q01959 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms