Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EFNB1P98172 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EFNB1P98172 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EFNB1P98172 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
EFNB1P98172 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms