Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP2P78314 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms