Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CENPAP49450 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CENPAP49450 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms