Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GCLMP48507 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GCLMP48507 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GCLMP48507 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms