Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ITGAEP38570 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms