Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOX11P35716 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOX11P35716 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOX11P35716 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SOX11P35716 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SOX11P35716 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SOX11P35716 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms