Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GJA4P35212 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GJA4P35212 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms