Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP6P35125 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP6P35125 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP6P35125 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP6P35125 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms