Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP1P30622 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms