Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ABCD3P28288 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ABCD3P28288 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms