Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMB4P28070 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms