Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POU1F1P28069 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms