Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LMO2P25791 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LMO2P25791 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LMO2P25791 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms