Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSMB1P20618 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PSMB1P20618 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms