Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
VAV1P15498 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
VAV1P15498 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
VAV1P15498 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms