Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GABRA1P14867 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms