Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA4P13612 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms