Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTN1P12814 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTN1P12814 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms