Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TRAPPC2BP0DI82 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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