Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGB2P05107 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGB2P05107 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms