Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLIT2O94813 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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