Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CTNSO60931 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms