Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMPRSS11DO60235 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms