Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
HOXA3O43365 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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