Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGSM2O43147 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms