Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FANCAO15360 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FANCAO15360 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FANCAO15360 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FANCAO15360 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms