Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SETD1AO15047 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms