Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PATL2C9JE40 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms