Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CENPBD1B2RD01 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms