Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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SH3BP1Q9Y3L3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SH3BP1Q9Y3L3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SH3BP1Q9Y3L3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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