Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9Y3F1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9Y3F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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