Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
COG6Q9Y2V7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COG6Q9Y2V7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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