Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms