Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2F5

ICE1, Little elongation complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ICE1Q9Y2F5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ICE1Q9Y2F5 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ICE1Q9Y2F5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms