Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
L1RE1Q9UN81 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms