Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FBXL4Q9UKA2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FBXL4Q9UKA2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms