Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms