Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF11Q9UIL8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF11Q9UIL8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms