Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DKK4Q9UBT3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
DKK4Q9UBT3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms