Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CCDC180Q9P1Z9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC180Q9P1Z9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms