Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHRF1Q9P1Y6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms