Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ABCC13Q9NSE7 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ABCC13Q9NSE7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms